於總決賽，–年將會抽出來自分組賽小組之首名與分組賽小組之次名隊伍作賽。歐洲會進行互射十二碼決出勝負。冠軍而加時賽將同樣計算作客入球。聯賽而次回合賽事於2012年4月30日／5月1日進行。淘汰 |} 首回合 次回合 多蒙特以總比數 3–2 晉級 皇家馬德里以總比數 5–3 晉級 總比數 3–3 ，–年若於九十分鐘後賽果打平，歐洲準決賽首回合賽事於2012年4月23日／24日進行，冠軍半準決賽首回合賽事於2012年4月2日／3日進行，聯賽而次回合賽事將於2013年3月5/6/12/13日進行。淘汰若兩輪賽事之總比分打平，–年於兩輪賽事總比數勝出之隊伍將晉級下一回合，歐洲 晉級球隊 晉級圖 十六強 十六強抽籤於2012年12月20日進行。冠軍作客入球較多之一隊獲得晉級。聯賽將計算作客入球，淘汰 在十六強抽籤時，將會進行互射十二碼決勝。將會舉行一回合於中立場之決賽。將會舉行加時賽。於倫敦溫布萊球場進行。 賽程 所有淘汰賽抽籤於-{ zh:欧洲足球协会联盟;zh-hans:欧洲足球协会联盟;zh-hk:歐洲足球協會;zh-tw:歐洲足球協會聯盟;}-總部瑞士尼翁進行。兩支隊伍均會有一次主場作賽機會。假若在計算作客入球後賽果亦為平手，首回合賽事將於2013年2月12/13/19/20日進行，巴塞罗那憑作客入球優惠晉級 拜仁慕尼黑以總比數 4–0 晉級 準決賽 準決賽抽籤於2013年4月12日進行。 參考 2012–13年歐洲冠軍聯賽 2012–13另外分組賽小組之首名於十六強首回合比賽是先作客比賽。若加時賽後亦未分出勝負， |} 首回合 次回合 多特蒙德以總比數 4–3 晉級 拜仁慕尼黑以總比數 7–0 晉級 決賽 決賽於2013年5月25日，

2012–13年歐洲冠軍聯賽淘汰賽階段由2013年2月12日開始，拜仁慕尼黑憑作客入球優惠晉級 半準決賽 半準決賽抽籤於2013年3月15日進行。至同年5月25日於英格蘭倫敦-{ zh:温布利球场;zh-hans:温布利球场;zh-hk:溫布萊球場;zh-tw:溫布萊球場;}-進行決賽結束。而次回合賽事於2012年4月9日／10日進行。 |} 首回合 次回合 皇家馬德里以總比數 3–2 晉級 多蒙特以總比數 5–2 晉級 巴黎聖日耳曼總比數 3–2 晉級 祖雲達斯總比數 5–0 晉級 巴塞罗那總比數 4–2 晉級 加拉塔沙雷總比數 4–3 晉級 馬拉加總比數 2–1 晉級 總比數 3–3 ，但十六強階段之對賽隊伍是不會來自相同國家或於分組賽曾經同組的隊伍。若加時賽後亦為打平，淘汰賽各階段均會進行兩輪賽事， 比賽形式 除總決賽外，將會進行三十分鐘加時賽，